Você precisa apenas ir à sua loja Shopify, clicar em "apps", como mostra na imagem abaixo:

Feito isso, clique em excluir

Pronto! Após fazer isso, sua loja não aparecerá em nosso dashboard.
Obs. Ela não aparecerá no dashboard, mas ainda estará vinculada a sua conta. Caso queira trocar a loja de conta, favor entrar em contato com o suporte.

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Actualizado em: 25 / 10 / 2021